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作物因土壤重茬而出现根系问题，严重的话还可引起植物枯萎病、叶枯病、病毒病等危害，因此重茬土地问题一直是很重要的问题，微生物菌肥对重茬土壤的改良效果明显，其作用不可替代，下面来简单了解一下。
由于常年连作和施肥不当，造成土壤中大量微量元素不平衡，缺素现象严重，直接导致作物产量低下，土壤中存在着有害的真菌、细菌、线虫和病毒等，它们在土壤中生长，当条件适宜时，它们会大量繁殖，从根部或茎部感染发病，由于真菌的危害，在蔬菜栽培过程中，根部病害十分严重。
根结线虫一般生存于土壤中5~30厘米的范围内，一般可存活1~3年，适宜生存温度25~30℃。成、卵包括成虫与病残体一起留在土壤中越冬，越冬卵孵化出的幼虫与成虫均由根部侵入，循环往复侵染，因此，水是染病土壤、染病植物的主要传播途径。
由于常年施用化肥不当，导致土壤酸碱化、板结严重，造成钙、镁、硼等元素缺乏，导致根腐、青枯等细菌性病害的发生；由于化肥用量大，耕层过浅，造成根系不发达，叶片僵硬，植株矮小，产量低，病害多等现象。
事实上，防治土壤重茬需要学会使用生物菌肥，科学搭配可以更好地发挥生物菌肥对改善土壤重茬的作用，增加生态有机肥用量；由于有机质能促进土壤团粒结构，保持土壤中团粒结构不减少，提高了肥料利用率。
重视微生物菌肥的应用。经过处理后的土壤应及时补充有益微生物，翻耕时，每亩施用生物菌肥，改善土壤微生物环境；翻耕时，可穴施，养护根系，提高抗性。
